Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLGNO14967 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLGNO14967 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLGNO14967 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLGNO14967 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLGNO14967 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLGNO14967 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLGNO14967 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLGNO14967 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLGNO14967 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms