Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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