Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf170A2RU37 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms