Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGKV1-27A0A075B6S5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms