Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC13A3-201ENST00000279027 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DERL2-201ENST00000158771 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 EDAR-202ENST00000376651 4303 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE1-208ENST00000556143 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAK1-202ENST00000341421 4620 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 STK36-207ENST00000440309 4721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ABHD2-201ENST00000352732 8735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR176-202ENST00000543580 1755 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM5D-201ENST00000317961 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 POM121L1P-201ENST00000402027 1934 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK8-207ENST00000395611 5844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SNHG14-208ENST00000453082 6087 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MYT1-202ENST00000360149 2061 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMA4-205ENST00000389463 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NOP2-201ENST00000322166 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CPA4-201ENST00000222482 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FPGT-TNNI3K-203ENST00000370899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TROAP-215ENST00000551245 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PLAGL1-203ENST00000367571 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KIRREL1-201ENST00000359209 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GUCY1B3-201ENST00000264424 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX23-201ENST00000308025 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GLI1-207ENST00000543426 3394 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMKK2-216ENST00000545538 3797 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CRX-207ENST00000613299 4193 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 VDR-206ENST00000549336 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM10-207ENST00000528746 6182 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RGPD5-201ENST00000016946 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ASCC3-204ENST00000369162 8146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CREB1-206ENST00000432329 7650 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1257-201ENST00000265068 6034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB43-202ENST00000373464 5965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NRAP-204ENST00000369360 5535 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TMX3-201ENST00000299608 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TNC-211ENST00000537320 4946 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TARID-209ENST00000630119 4294 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 QTRT2-201ENST00000281273 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB4-203ENST00000359206 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 OGDHL-202ENST00000419399 3588 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB2-204ENST00000377315 3461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MEGF11-202ENST00000395614 3423 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRP2-210ENST00000565858 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM13C-215ENST00000614220 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.8 ms