RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.34■□□□□ 0.69
TMX3-201ENST00000299608 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.34■□□□□ 0.53
TMX3-201ENST00000299608 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
TMX3-201ENST00000299608 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.86■□□□□ 0.45
TMX3-201ENST00000299608 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.53■□□□□ 0.4
TMX3-201ENST00000299608 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
TMX3-201ENST00000299608 APLP2Q06481 763 aa16.96■□□□□ 0.31
TMX3-201ENST00000299608 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TMX3-201ENST00000299608 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
TMX3-201ENST00000299608 TRIM41Q8WV44 630 aa16.67■□□□□ 0.26
TMX3-201ENST00000299608 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TMX3-201ENST00000299608 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TMX3-201ENST00000299608 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.47■□□□□ 0.23
TMX3-201ENST00000299608 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
TMX3-201ENST00000299608 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TMX3-201ENST00000299608 ABCC9O60706 1549 aa16.19■□□□□ 0.18
TMX3-201ENST00000299608 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
TMX3-201ENST00000299608 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TMX3-201ENST00000299608 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TMX3-201ENST00000299608 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TMX3-201ENST00000299608 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.05■□□□□ 0.16
TMX3-201ENST00000299608 ITGAEP38570 1179 aa16■□□□□ 0.15
TMX3-201ENST00000299608 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.95■□□□□ 0.14
TMX3-201ENST00000299608 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TMX3-201ENST00000299608 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.89■□□□□ 0.13
TMX3-201ENST00000299608 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
TMX3-201ENST00000299608 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.74■□□□□ 0.11
TMX3-201ENST00000299608 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TMX3-201ENST00000299608 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
TMX3-201ENST00000299608 FBLN2P98095 1184 aa15.7■□□□□ 0.1
TMX3-201ENST00000299608 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TMX3-201ENST00000299608 NEFLP07196 543 aa15.57■□□□□ 0.08
TMX3-201ENST00000299608 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TMX3-201ENST00000299608 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.5■□□□□ 0.07
TMX3-201ENST00000299608 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TMX3-201ENST00000299608 ARID3CA6NKF2 412 aa15.46■□□□□ 0.06
TMX3-201ENST00000299608 TRIM52Q96A61 297 aa15.45■□□□□ 0.06
TMX3-201ENST00000299608 P3H3Q8IVL6 736 aa15.43■□□□□ 0.06
TMX3-201ENST00000299608 HRCP23327 699 aa15.42■□□□□ 0.06
TMX3-201ENST00000299608 NEUROD1Q13562 356 aa15.33■□□□□ 0.05
TMX3-201ENST00000299608 SCRIBQ14160 1630 aa15.33■□□□□ 0.04
TMX3-201ENST00000299608 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
TMX3-201ENST00000299608 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.29■□□□□ 0.04
TMX3-201ENST00000299608 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
TMX3-201ENST00000299608 BCANQ96GW7 911 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX3-201ENST00000299608 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
TMX3-201ENST00000299608 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TMX3-201ENST00000299608 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TMX3-201ENST00000299608 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.08■□□□□ 0.01
TMX3-201ENST00000299608 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 0
TMX3-201ENST00000299608 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
TMX3-201ENST00000299608 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
TMX3-201ENST00000299608 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TMX3-201ENST00000299608 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TMX3-201ENST00000299608 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.98□□□□□ -0.01
TMX3-201ENST00000299608 SLC24A1O60721 1099 aa14.96□□□□□ -0.01
TMX3-201ENST00000299608 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.93□□□□□ -0.02
TMX3-201ENST00000299608 ANP32CO43423 234 aa14.92□□□□□ -0.02
TMX3-201ENST00000299608 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.91□□□□□ -0.02
TMX3-201ENST00000299608 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
TMX3-201ENST00000299608 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.87□□□□□ -0.03
TMX3-201ENST00000299608 BCL11AQ9H165 835 aa14.85□□□□□ -0.03
TMX3-201ENST00000299608 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.85□□□□□ -0.03
TMX3-201ENST00000299608 KCNH8Q96L42 1107 aa14.81□□□□□ -0.04
TMX3-201ENST00000299608 NEFMP07197 916 aa14.81□□□□□ -0.04
TMX3-201ENST00000299608 TSPY4P0CV99 314 aa14.8□□□□□ -0.04
TMX3-201ENST00000299608 TSPY10P0CW01 314 aa14.8□□□□□ -0.04
TMX3-201ENST00000299608 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TMX3-201ENST00000299608 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.76□□□□□ -0.05
TMX3-201ENST00000299608 TONSLQ96HA7 1378 aa14.74□□□□□ -0.05
TMX3-201ENST00000299608 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TMX3-201ENST00000299608 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TMX3-201ENST00000299608 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TMX3-201ENST00000299608 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TMX3-201ENST00000299608 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.7□□□□□ -0.06
TMX3-201ENST00000299608 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TMX3-201ENST00000299608 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.68□□□□□ -0.06
TMX3-201ENST00000299608 NACADO15069 1562 aa14.67□□□□□ -0.06
TMX3-201ENST00000299608 CLIP1P30622 1438 aa14.66□□□□□ -0.06
TMX3-201ENST00000299608 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.66□□□□□ -0.06
TMX3-201ENST00000299608 ERCC6Q03468 1493 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX3-201ENST00000299608 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TMX3-201ENST00000299608 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
TMX3-201ENST00000299608 PLEKHG5O94827 1062 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX3-201ENST00000299608 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TMX3-201ENST00000299608 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.59□□□□□ -0.07
TMX3-201ENST00000299608 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
TMX3-201ENST00000299608 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
TMX3-201ENST00000299608 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.55□□□□□ -0.08
TMX3-201ENST00000299608 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TMX3-201ENST00000299608 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TMX3-201ENST00000299608 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TMX3-201ENST00000299608 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TMX3-201ENST00000299608 MYT1Q01538 1121 aa14.54□□□□□ -0.08
TMX3-201ENST00000299608 RGL3Q3MIN7 710 aa14.54□□□□□ -0.08
TMX3-201ENST00000299608 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.54□□□□□ -0.08
TMX3-201ENST00000299608 KIF27Q86VH2 1401 aa14.54□□□□□ -0.08
TMX3-201ENST00000299608 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.51□□□□□ -0.09
TMX3-201ENST00000299608 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
TMX3-201ENST00000299608 C14orf37Q86TY3 774 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.9 ms