Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005518.2-201ENST00000603254 282 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00893-212ENST00000609161 524 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.114-201ENST00000618435 279 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC28-AS1_4.1-201ENST00000619378 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.95-201ENST00000619648 282 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FO538757.2-201ENST00000624431 570 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NRP1-208ENST00000395995 5826 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-225ENST00000636276 4097 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA6A-201ENST00000290438 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH1L1-210ENST00000472186 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PHKA1-203ENST00000373542 6020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR3G-204ENST00000504930 3251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPYL1-201ENST00000368608 3326 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MYOM2-212ENST00000523438 3328 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH2-201ENST00000269141 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MICAL2-217ENST00000527546 3358 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO38-202ENST00000340253 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NMNAT2-202ENST00000294868 5448 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF597-201ENST00000301744 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS25-201ENST00000253686 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF791-201ENST00000343325 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA2-201ENST00000394576 4605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL3-201ENST00000309755 6806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L13-213ENST00000538149 4797 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH11Y-207ENST00000622698 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE28-206ENST00000508471 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CXorf57-202ENST00000372548 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF1C-218ENST00000567759 3879 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 EFHB-201ENST00000295824 2823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4A11-203ENST00000371905 1725 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DAB1-205ENST00000371236 5298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC131392.2-201ENST00000505635 4332 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353625.1-201ENST00000569097 3131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003393.1-201ENST00000532153 4476 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 UBOX5-201ENST00000217173 4631 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 BOC-215ENST00000495514 4646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP58-202ENST00000369704 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO15A-203ENST00000418233 3411 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NDST1-207ENST00000523767 3449 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DPP3P1-201ENST00000508984 2063 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GAA-202ENST00000390015 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms