Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 PTGS1-205ENST00000540753 5375 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ITGA4-203ENST00000397033 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PCYOX1-204ENST00000433351 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARSJ-201ENST00000315366 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC7A11-AS1-202ENST00000510767 4654 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 COA7-201ENST00000371538 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF9-232ENST00000637417 5114 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LARS2-202ENST00000414984 2800 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DIAPH3-203ENST00000400319 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF2S1-201ENST00000256383 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 USP17L15-202ENST00000621432 1680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF9-201ENST00000265529 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RAP2C-205ENST00000620646 3341 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MPP2-218ENST00000536246 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GRAMD2A-201ENST00000309731 3281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAM17-201ENST00000310823 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 WASHC2A-204ENST00000399339 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 STAG1-210ENST00000629124 4322 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PLA2G2C-202ENST00000429261 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GPBP1L1-202ENST00000355105 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AL353597.3-201ENST00000624365 3745 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PEX5-202ENST00000266564 3170 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC8A-202ENST00000372599 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 APLNR-202ENST00000606794 3609 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SMARCC2-209ENST00000550164 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZSCAN22-201ENST00000329665 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 EPB42-201ENST00000300215 4553 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AL035696.1-201ENST00000381078 2007 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF37A-206ENST00000638053 4448 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CLIP3-201ENST00000360535 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZAN-206ENST00000618565 8651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CPEB1-208ENST00000611163 1919 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNNA2-209ENST00000466387 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE6A-201ENST00000255266 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 UNC45B-202ENST00000394570 5638 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SULF1-203ENST00000419716 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MEG3-220ENST00000522771 6984 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 APH1B-201ENST00000261879 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CSMD2-203ENST00000373377 3212 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ACAD11-201ENST00000264990 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PRAMEF8-201ENST00000357367 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF343-201ENST00000278772 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.8 ms