Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
U3KQE9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
U3KQE9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
U3KQE9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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