Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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CAPN6Q9Y6Q1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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CAPN6Q9Y6Q1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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CAPN6Q9Y6Q1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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CAPN6Q9Y6Q1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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CAPN6Q9Y6Q1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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CAPN6Q9Y6Q1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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CAPN6Q9Y6Q1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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