Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LEMD3Q9Y2U8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms