Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIF3AQ9Y2N7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms