Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC4Q9Y296 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms