Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CASP8AP2Q9UKL3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms