Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNGB3Q9NQW8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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