Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
WDR55Q9H6Y2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
WDR55Q9H6Y2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms