Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms