Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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