Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM43Q9BTV4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms