Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5SQ99766 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms