Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms