Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA6DQ8NFY4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms