Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC191Q8NCU4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms