Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APTXQ7Z2E3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
APTXQ7Z2E3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms