Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM88Q6PEY1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms