Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTR9Q6PD62 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTR9Q6PD62 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms