Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC158Q5M9N0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms