Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COLEC12Q5KU26 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms