Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPAT3Q53EU6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms