Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPRNQ4KMQ1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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