Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRY2Q49AN0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms