Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL40Q2TBA0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms