Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA4Q16363 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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