Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NECTIN1Q15223 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN1Q15223 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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