Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BRD3Q15059 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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BRD3Q15059 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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BRD3Q15059 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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BRD3Q15059 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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BRD3Q15059 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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BRD3Q15059 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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BRD3Q15059 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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BRD3Q15059 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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BRD3Q15059 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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BRD3Q15059 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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BRD3Q15059 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRD3Q15059 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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