Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBM39Q14498 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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