Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOFQ13790 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOFQ13790 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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