Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC1Q13547 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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