Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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SP140Q13342 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP140Q13342 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SP140Q13342 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SP140Q13342 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP140Q13342 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP140Q13342 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP140Q13342 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP140Q13342 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP140Q13342 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP140Q13342 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP140Q13342 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP140Q13342 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP140Q13342 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SP140Q13342 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SP140Q13342 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SP140Q13342 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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