Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYP27A1Q02318 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms