Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPCAP84074 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HPCAP84074 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPCAP84074 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPCAP84074 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPCAP84074 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPCAP84074 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPCAP84074 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPCAP84074 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPCAP84074 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPCAP84074 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPCAP84074 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HPCAP84074 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HPCAP84074 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms