Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms