Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RPS28P62857 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RPS28P62857 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPS28P62857 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms