Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UFM1P61960 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UFM1P61960 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UFM1P61960 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UFM1P61960 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms