Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms