Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF4P34130 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF4P34130 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF4P34130 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF4P34130 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF4P34130 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF4P34130 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF4P34130 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF4P34130 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF4P34130 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTF4P34130 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTF4P34130 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTF4P34130 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTF4P34130 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTF4P34130 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTF4P34130 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTF4P34130 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTF4P34130 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF4P34130 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF4P34130 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF4P34130 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF4P34130 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms