Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRABP1P29762 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRABP1P29762 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms