Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EPHA1P21709 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA1P21709 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms