Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FGF3P11487 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FGF3P11487 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FGF3P11487 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FGF3P11487 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FGF3P11487 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FGF3P11487 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FGF3P11487 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FGF3P11487 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FGF3P11487 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FGF3P11487 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FGF3P11487 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FGF3P11487 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FGF3P11487 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FGF3P11487 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FGF3P11487 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FGF3P11487 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FGF3P11487 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FGF3P11487 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FGF3P11487 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FGF3P11487 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FGF3P11487 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FGF3P11487 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FGF3P11487 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FGF3P11487 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FGF3P11487 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FGF3P11487 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms