Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P0C879 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P0C879 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P0C879 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P0C879 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P0C879 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P0C879 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P0C879 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P0C879 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P0C879 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
P0C879 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P0C879 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P0C879 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P0C879 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P0C879 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms